某天,小新(矢島晶子 配音)閑逛的時候撿到一個動感超人的面具,戴上面具後,小新發現自己竟然能和動感超人通話。他被任命為代表正義的動感間諜,專門與邪惡勢力作戰,並且見到了他的搭檔——7歲女孩蘇諾萌·檸檬(愛河裏花子 配音)。在檸檬的帶領下,小新開始作為動感間諜的艱苦訓練。在這一過程中,面向兇惡的怪大叔不斷偷襲小新,而在這一系列事件背後,似乎又隱藏著兩個神秘的國家——無聲屁共和國與不放屁王國。看似善良的檸檬也變得正邪難辨。不久,小新更和檸檬闖入了困難重重的不放屁王國……